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| creator |
Dichev, Kiril
| | date |
2007-05-16
| | | | description |
107 pages
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Die Rechenzeiten von Molekulardynamiksimulationen sind heute auch
auf Höchstleistungsrechnern oft noch sehr lang. Es ist
wünschenswert auch während dieser Zeit Kontrolle über den Verlauf
der Berechnung zu haben, um nicht am Ende vom Ergebnis überrascht
zu werden. Neben einer Online-Visualisierung, für die hier eine
VR-Umgebung genutzt wird, ist die Steuerung durch interaktives
Eingreifen erklärtes Ziel. Es sollen Simulations- und
Steuerungsparameter während eines Simulationslaufes modifiziert
werden können, wobei diese Änderungen eine direkte unmittelbare
Auswirkung auf die Simulation haben.
Den Schwerpunkt der Arbeit bildet die Ausbildung der Interfaces,
sowie die Synchronisation und Kommunikation zwischen den einzelnen
Komponenten. Hierzu ist zunächst der Prototyp einer reaktiven,
multithreaded Simulationskomponente mit einer Socket-basierten
Kommunikationsschnittstelle als Entwurfsmuster zu entwickeln. Die
Datenübertragung kann evtl. nebenläufig zur Berechnung
durchgeführt werden. Während die Steuerungsdaten wenig
Kommunikationsvolumen einnehmen, sind zur Visualisierung von
Partikelsimulationen eine Vielzahl an Daten zu übertragen. Zur
Beschleunigung der Datenübertragung ist die Möglichkeit einer
Datenkompression zu untersuchen.
Die entwickelten Konzepte sollen konkret umgesetzt werden. Die
Implementierung erfolgt auf Basis der am HLRS entwickelten
COllaborative VIsualization and Simulation Environment (COVISE), die
durch Module oder Plugins auf die Bedürfnisse dieser neuen
Anwendung erweitert werden muss, aber auf Vorarbeiten aufbauen kann.
Zur Molekulardynamik-Simulation wird die am IPVS/SgS im Rahmen eines
Forschungsprojekts entwickelte parallele Software ls1 eingesetzt,
welche reaktiv in das neu geschaffene verteilte System eingebunden
wird. Die Software-Architektur muss prinzipiell aber auch die
Anbindung alternativer Visualisierungsumgebungen und
Simlationsmodule zulassen, was exemplarisch für die Visualisierung
zu zeigen ist.
| | format |
application/pdf
| | 1354507 Bytes | |